Los siguientes mapas se encuentran nuevamente en el Atlas: Ciudad antigua, Lago árido, Bosque pálido, Valle de zarzas, Aposentos del entierro, Cañón, Conservatorio, Núcleo, Cráter, Poblado carmesí, Mina de cristal, Desierto, Perforación, Mar seco, Campos, Fundición, Jardines, Gueto, Gruta, Valle de la jungla, Laboratorio, Ruinas descuidadas, Parque, Plaza, Murallas, Cámaras de reliquias, Sepulcro, Guarida de la araña y Charca de desechos.
Los siguientes mapas ya no se encuentran en el atlas: Callejones, Tumba arácnida, Túmulos, Playa, Celdas, Río helado, Juzgado, Mazmorra, Excavación, Fábrica, Hondonada fúngica, Geoda, Cementerio, Mansión embrujada, Lago de lava, Línea ley, Malformación, Mausoleo, Corral, Fantasmagoría, Hoyo, Bloques primordiales, Charca primordial, Silo, Fumarolas de azufre, Ciudad hundida, Terraza, Torre y Canales.
Los grados y las ubicaciones de los mapas han cambiado (aunque las ubicaciones de los "pines" no han cambiado). La mayoría de los mapas ahora se encuentran inicialmente en un grado diferente.
Algunos de los jefes de mapa que debes derrotar para mejorar tu panteón han cambiado debido a los cambios que recibió el Atlas.
Las recetas de fabricación que antes se desbloqueaban en mapas que han sido eliminados del Atlas ahora se pueden encontrar en otros mapas que sí están actualmente en el Atlas.
Como resultado de estos cambios, algunas cartas de adivinación han encontrado nuevos hogares.
Cólera cerúlea, Ratas, El extractor incansable, el Regreso de la rata y Tres rostros en la oscuridad ahora se pueden encontrar en el mapa de Puerto.
El demonio y La ira ahora se pueden encontrar en el mapa de Cráter.
El maestro ahora se puede encontrar en el mapa de Campos.